Изучение микробиомных профилей органов дыхания у детей с муковисцидозом в ХМАО-Югре

Руководитель проекта

Донников Максим Юрьевич, кандидат медицинских наук. Ведущий научный сотрудник НОЦ МИ СурГУ

Грантодатель:
Российский научный фонд, Департамент образования и науки Ханты-Мансийского автономного округа – Югры.

Сроки реализации:
2024 – 2025 гг.

Аннотация проекта:
Муковисцидоз (МВ) является наиболее распространенным аутосомно-рецессивным заболеванием среди европеоидов. В России в 2021 г. официально зарегистрировано 3 969 пациентов. МВ связан с мутациями в гене CFTR. Наиболее серьезно поражаются при МВ легкие, что является основной причиной сокращения продолжительности жизни у пациентов. Регулярное массированное использование антибиотиков вследствие рецидивирующих легочных инфекций, мальабсорбция, высокоэнергетическая жирная диета, применение панкреатических ферментов и нарушение врожденного иммунитета определяют развитие микробного дисбиоза как легких, так и кишечника у пациентов, страдающих МВ.

Отсутствие корреляции между результатами классической микробиологии и клиническим состоянием у пациентов с МВ побудило исследователей к использованию молекулярно-генетических методов, позволяющих оценить многообразие сложного микробного сообщества респираторного тракта. Так, секвенирование гена 16S рРНК позволило идентифицировать и количественно подсчитать бактериальные таксоны в клинических образцах мокроты у больных с МВ. В последнее время исследователи обращают внимание на таксоны, составляющие минорные доли в микробиоме респираторного тракта. Роль таких микроорганизмов все еще слабо исследована и может быть связана с бактериальный синергизмом или антагонизмом в дыхательных путях при МВ.

За последнее десятилетие были разработаны низкомолекулярные препараты, направленные на устранение первичного дефекта белка CFTR и восстановление его функции. Это радикально изменило подход к ведению пациентов с МВ, обеспечив значительные улучшения функции легких, роста и прогнозируемой продолжительности жизни. Последний препарат с модуляторной функцией CFTR, одобренный для клинического применения – элексакафтор-тезакафтор-ивакафтор (ELX/TEZ/IVA), включает два корректора белка CFTR (ELX и IVA) и один потенциатор CFTR (TEZ). Учитывая прогрессирующий характер МВ, начало терапии в раннем детстве имеет решающее значение для остановки прогрессирования заболевания. Комбинация препаратов ELX/TEZ/IVA была одобрена FDA для педиатрических пациентов в 2019 г. В России препарат «Трикафта» был одобрен в 2022 г. Детская когорта пациентов с МВ в ХМАО-Югре также начала переход на таргетную терапию. К осени 2023 г., по данным Сацук Н.А. (руководитель детского центра МВ в ХМАО-Югре), на таргетной терапии находится 35 человек.

Оценка влияния ELX/TEZ/IVA на клинические исходы и микробиом легких у детей с МВ требует целенаправленного изучения. На сегодняшний день исследования, изучающие влияние модуляторов CFTR на легочной микробиом, были ограничены использованием отдельных составов модулятора или небольших групп. Важно отметить, что до настоящего времени ни одно исследование не охарактеризовало влияние таргетного препарата «Трикафта» (ELX/TEZ/IVA) на микробиом легких у детей с МВ в ХМАО-Югре.

Подобные углубленные исследования микробиома легких не проводились на когорте пациентов с МВ, проживающих в ХМАО-Югре, до начала использования таргетной терапии. Представляет интерес как научный, так и практический, исследование влияния постоянного приема препаратов таргетной терапии пациентами с МВ, проживающими в ХМАО-Югре, на состав и разнообразие микробиома респираторной системы.